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16S rRNA基因测序

16S rRNA基因测序

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产品名称: 16S rRNA基因测序

英文名称: 16S rRNA-seq

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产品价格: 2000

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北京诺赛基因组研究中心有限公司
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 技术简介: 
       指对环境细菌的16S rRNA进行高通量测序。16S rRNA结构既具有保守性,又具有高变性。通过测序结果与数据库比较,可以分析环境细菌的菌群结构和多样性。 

生物信息分析: 
1. 序列质量控制。 
2. 操作分类单元(OTU)的划分 
a)   按照序列数量生成OTU的丰度谱。 
b)   基于OTU 丰度谱进行的样本比较,如层次聚类、主成分分析等。 
c)   比较组间差异,找出贡献差异的OTU,阐述其生物学意义。 
3. 物种分类的鉴定 
a)   按照序列数量在不同层次生成物种分类的丰度谱,通常在门和属的水平进行。 
比较组间差异,找出差异显著的分类单元,阐述其生物学意义。 

送样要求:

样品 要求
DNA ≥5ug
浓度 ≥50ng/ul
纯度 OD 260/280 =1.8~2.0 ;无蛋白及RNA 污染