基因转录水平的研究是功能基因组学和医学研究的基础。数字基因表达谱（Digital Gene Expression Tag Profiling, DGE）利用新一代高通量测序技术和高性能计算分析技术，能够全面、经济、快速地检测某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况，已被广泛应用于基础科学研究、医学研究和药物研发等领域。

技术优势

◆数字化信号：测序直接获得序列，无背景噪音，无交叉杂交。可鉴别序列之间一个碱基的差异；

◆高通量：一次测序产生300万序列，检测10～30万种序列标签；

◆可重复性高：同一实验室两次独立实验的相关性超过99%，不同实验室两次独立实验的相关性高达98%^[1]；

◆检测阈值宽：跨越6个数量级的宽检测阈值，既能检测低至2个拷贝的稀有转录本，也能精确定量几十万拷贝的高表达转录本；

◆检测新转录本：不依赖已知基因，可检测新转录本；

◆检测反义链转录本：不依赖已知基因，可检测反义链转录本；

◆分析兼容性：数据格式与芯片相同，与芯片的分析软件兼容。

研究内容

        通过高效酶切获取每条mRNA的特定标签(Tag)，利用新一代测序技术对样本中数以百万计的mRNA标签进行序列测定，从而对基因表达水平进行数字化分析。

一、标准信息分析

◆       对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量tags的处理；

◆       测序评估；

◆       基因表达注释；

◆       差异表达基因分析；

◆       反义链的转录分析；

◆       新转录本预测；

◆       差异基因表达模式聚类分析；

◆       GO功能富集分析；

◆       Pathway显著性富集分析；

◆       蛋白互作网络分析。

二、定制化信息分析

◆       可结合客户的需求，协商确定定制化信息分析内容。